Se había visto envuelto en algunas polémicas con algunos jugadores representativos de la institución, camiseta del inter de milan que incluso llamaron al presidente Carlos Portell para decirle que «no aguantaban más a La Volpe». Al año siguiente, el empresario Carlos Portel asumió como nuevo presidente de la institución, prevaleciendo sobre el otro candidato, Horacio Sola (hijo de Florencio Sola). A principios del Apertura de 2003, Julio César Falcioni, y por medio de la promoción de jugadores como Daniel Bilos y Rodrigo Palacio, logró armar un plantel de primera línea y Banfield consiguió 62 puntos en la temporada, quedando tercero y clasificando a las copas internacionales (Sudamericana 2004 Y Libertadores 2005). En la Copa Libertadores de 2005, con jugadores como Jorge Cervera y Antonio Barijho, pasó de ronda como 2° del grupo con 11 puntos, eliminó en Octavos de final a Independiente de Medellín con un global de 5-0 y cayó eliminado en Cuartos ante River, finalizando en el 7° puesto de la copa, alcanzando el lugar n.º 23 del Ranking Mundial de Clubes de la FIFA.

El 25 de agosto de 2017, se inaugura el Nuevo Gol Sur, ampliando la capacidad del feudo verdiblanco a 60 721 espectadores. Lindo gol. Racing tomaría ventaja de 2-0 y Huracán finalmente empata 2-2, con un tanto en posición adelantada y otro en contra. Empató y luego derrotó 10-0 a River Plate “C”; le ganó a Boca Juniors “B”; venció 10-0 a Racing “B”, entre otros. En Primera, Banfield fue entrenado por Oscar López y Oscar Cavallero, con una plantilla renovada como el exjugador de Ferro Carril Oeste Oscar Acosta y el experimentado arquero Ángel D. Comizzo (que había sido relegado de River Plate por el entonces técnico Daniel Passarella eran algunos de los nuevos jugadores). Con jugadores como Rafael Sanz, Eduardo Silvera, Juan Bautista Besuzzo, Alfredo De Terán, Armando Farro y otros, Banfield hizo una sorprendente campaña y atípica para clubes recién ascendidos, por lo que el diario «El Pampero» bautizó al equipo con el nombre de «El Taladro», ya que a sus rivales les taladraba el arco, apodo que pasó a la historia como el seudónimo oficial de la institución. Tres no se jugaron, el Taladro ganó los puntos en dos de ellos y perdió en el restante.

En 1919 fue ganador de la Zona Sur, sumando 28 puntos en 16 partidos y clasificó a la serie final. Banfield no tuvo un buen comienzo durante esta década, incluso estuvo jugando en la zona de descenso. Con un equipo totalmente nuevo, Banfield se fue al descenso en 1911. Pero conducido por el capitán Adolfo Pellens, en 1912 ganó el campeonato de la tercera categoría asegurándose así el retorno. En junio de 2012, Banfield descendió a la segunda división (Primera B Nacional) después de ser derrotado por Colón de Santa Fe 3-0. Banfield había quedado penúltimo en la tabla de promedios como resultado de una paupérrima temporada, en la que cosechó solo 21 puntos de 38 encuentros, siendo una de las peores campañas de la historia del profesionalismo; incluso la exitosa temporada de 2009/10 no pudo evitar el descenso directo. En Primera militó en Primera División en 1913, 1914, 1915, 1916 y 1917. Los resultados mejoraron, el equipo se reconstruyó y fue tercero en 1914. Entre 1914 y 1918 aconteció la Primera Guerra Mundial y muchos de los jugadores tuvieron que actuar como combatientes.

En este período Banfield jugó 5 copas internacionales en 3 años, colándose entre los mejores 8 equipos del continente y vendiéndole jugadores a clubes europeos como Villareal, Anderlech, Olympique de Marsella y Liverpool. A causa del origen ferrocarrilero de la mayoría de los socios, se entienden esos colores porque se identificaban con las señales de peligro de las barreras. El técnico uruguayo Jorge da Silva (que había trabajado anteriormente en Godoy Cruz logrando una clasificación a la Copa Libertadores) fue contratado para reemplazar a La Volpe desde el Clausura de 2012. Banfield no logró buenos resultados, lo que precipitó la renuncia de Da Silva y su regreso a su país de origen. Luego de algunos reemplazos provisionales como entrenadores, Ricardo La Volpe fue elegido como nuevo entrenador. Davy Klaassen (Hilversum, Holanda Septentrional, Países Bajos, camiseta inter de milan blanca 21 de febrero de 1993) es un futbolista neerlandés que juega como centrocampista en el A. F. C. Ajax de la Eredivisie. Primer futbolista peruano en disputar 6 ediciones de las Clasificatorias a la Copa del Mundo. Los aficionados aportaron en pequeñas cantidades un total de 400 millones de pesetas a los que se sumaron otros 100 aportados en paquetes superiores al 1 % del capital social exigido.