En verano del año 2009, el club celebra el centenario con un triangular contra el Real Sporting de Gijón y el Athletic Club, en el primer partido de tan solo 45 minutos, el Sporting vence al Portu 0-2, en la final, los asturianos ganan 0-1 al Athletic y gana el trofeo triangular. Sin embargo, la sección de fútbol del Recreation Club tuvo una vida corta. Sin embargo, el presidente César Pastrana ratifica la continuidad del proceso llevado por el DT, con el férreo compromiso de buscar la mayor cantidad de victorias posibles. Su primer presidente fue Carlos Amigó Barberó. En la actualidad, representa futbolistas, varios de ellos internacionales, como el delantero colombiano Carlos Bacca, en su empresa INVSPORT. Actualmente disputa la Categoría Primera B, el segundo nivel del sistema de ligas del fútbol colombiano. Luego viajó a Guadalajara, México, para enfrentarse el 11 de marzo a las Chivas de Guadalajara en el mítico Estadio Jalisco; el partido finalizó 0:1 a favor de la escuadra roja y negra, sería la primera victoria por Copa Libertadores de un equipo colombiano en tierras aztecas. Cúcuta Deportivo clasificó a octavos de final, donde debió enfrentar de nuevo al Santos de Brasil, debido a que el Cúcuta Deportivo fue el 7° equipo mejor clasificado de los primeros de cada grupo y el Santos el 2° equipo mejor clasificado de los segundos de cada grupo.

Para esta edición de la Copa Libertadores el Cúcuta Deportivo obtiene su pase por ser el segundo mejor ubicado en la tabla de reclasificación de la temporada 2007 los dirigidos por Pedro Sarmiento son sembrados en el Grupo 6 junto a Santos (Brasil), Chivas de Guadalajara (México) y San José de Oruro (Bolivia). Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Fútbol en Brasil. 3:1 a Gremio y finalizó con una victoria épica contra Deportes Tolima 3:4 en partido disputado en Ibagué. En el partido de vuelta, perdieron 2-0 y fueron eliminados. Algunos jugadores se volvían invisibles durante el partido. Aquel equipo (Cúcuta Foot-ball Club) fue la base que representó a Norte de Santander en los Juegos Olímpicos Nacionales (actuales Juegos Nacionales) que se disputaron en Cali en 1928. Durante el desfile inaugural el 20 de diciembre, el equipo usó una bandera roja y negra en homenaje al futbolista Ciro Cogollo, un ídolo del fútbol local, impresion camisetas valencia quien fuera asesinado unos días antes del evento y cuyo asesinato consternó a la sociedad de la época convocando para sus honras fúnebres a una gran cantidad de gente. Durante ese período el Hércules estuvo en Segunda B durante cuatro años. La bandera del Junior está compuesta por nueve franjas horizontales, cinco rojas y cuatro blancas alternadas, siendo la superior y la inferior rojas.

La tela está compuesta por infinidad de murciélagos pequeños que sólo se aprecian al ampliarla. Según los periódicos de la época asistieron 10 000 aficionados que fueron a ver el estreno de la legión uruguaya en cabezada por Tulic, Terra, Zunino, Villaverde, Barbieri y Miloc, como las grandes contrataciones del once rojinegro.El partido lo ganó Cúcuta (2-1) Ha pasado mucho tiempo y el coliseo ubicado en barrio Lleras entre avenidas tercera y primera ha tenido cambios en su estructura. 12 jugadores de nacionalidad uruguaya. Más tarde los jugadores seleccionados deberán dar una muestra de orina. El Cúcuta tiene una de las hinchadas más grandes del país. En el 2015, fue llamado de urgencia por la Federación de Fútbol de Guinea Ecuatorial, para ser el coordinador de la selección absoluta de fútbol para la Copa de África del 2015, que disputó como local tras renunciar Marruecos de ser el anfitrión, por los problemas que hubo por el Ébola en varios países del continente africano.

Los argentinos Hugo Horacio Lóndero, Jorge Drago y Carlos Miguel Dizz alinearon con el elenco local. Para destacar el hecho de que Nacional se convirtió en el primer equipo en la historia de los torneos cortos, que logró un título de visitante sin haber ganado de local el primer partido de la final. En noviembre de 1926 el equipo realizó una gira en Venezuela enfrentando a la selección de Caracas el 23 de noviembre y el 25 de noviembre a la Guaira. Rolando Serrano. quien integró la primera selección Colombia de fútbol en un Mundial. Este se jugó en la ciudad de Cartagena entre el equipo descendido del campeonato colombiano, que fue el Atlético Bucaramanga, y dos equipos que ya estuvieron en la Categoría Primera A, que eran Unión Magdalena y Cúcuta Deportivo. En el 2000 el equipo clasifica séptimo en el todos contra todos jugados 20 partidos y en el cuadrangular semifinal queda tercero. «¿Por qué se juega la jornada 7 de LALIGA 2024/25 antes de la 6 y cuáles son los partidos adelantados? Este cuadrangular se vio envuelto en un posterior escándalo por un presunto arreglo de partidos del Valledupar Fútbol Club en beneficio del Real Cartagena y que perjudicó al Cúcuta.