En la temporada 1998-99 pasaron talentos como Iker Casillas, César Navas, camiseta selección argentina 3 estrellas Fernando Fernández o Francisco Sousa. ↑ S. Tavero, Fernando (29 de julio de 2024). «Gómez-Rey, un ‘chico prodigio’ en el banquillo del Madrid C». ↑ A pesar de que el reglamento establece que el trofeo será propiedad de los clubes si estos la ganan tres veces seguidas o cinco de forma alterna, la Junta Directiva de la RFEF decidió de forma excepcional y por unanimidad otorgar el trofeo al conjunto sevillano por el éxito de la Selección Española en la Copa Mundial de Fútbol de 2010 tras la petición del entonces presidente sevillista José María del Nido. 600-750 millones en recaudación mundial para evitar ser un fracaso de taquilla. Un acuerdo transitorio con el RSC Internacional Fútbol Club, el cual disputó sus encuentros como local en la Ciudad Deportiva de Valdebebas con numerosos jugadores de la cantera madridista fue el preludio de la refundación del segundo filial blanco. El Real Madrid C jugaba sus partidos en la Ciudad Real Madrid, nuevo camiseta de argentina situada en Valdebebas al igual que el resto de equipos de las categorías inferiores del club.
El campeonato de 1982 continuó con la misma estructura (liga a 3 vueltas con cuatro clasificados) y devolviendo la final a dos partidos, mientras que el de 1983 tuvo un aumento de los clasificados (aunque volviendo a 2 vueltas) a la segunda fase con una hexagonal en la que los tres mejores clasificados además del líder del torneo regular avanzaban a una cuadrangular final, mientras que el descenso se definía mediante liguilla como en años anteriores. 1): La camiseta no mostró patrocinio alguno en recuerdo de la historia de la camiseta desde 1902 hasta 1982 con motivo del «Centenario del Club». Tras disputar la temporada 2014-15 en la Tercera División debido al descenso de categoría de su equipo precedente, el Real Madrid Castilla Club de Fútbol, el club decidió suprimir el equipo finalizando así con más de sesenta años de historia del filial. Esto es, camiseta, pantalones y medias blancas, salvo la excepción de las medias durante los primeros años. Ya bajo esta denominación, el equipo consiguió su primer ascenso a la Segunda División «B» en la temporada 1992-93 y se mantuvo en ella durante 4 años, hasta que el descenso a dicha categoría del primer equipo filial les relegó a regresar a la Tercera División, en donde se han mantenido desde entonces.
Mientras que Universitario de Deportes se clasificó como ganador del Torneo Clausura y segundo en la tabla acumulada. Se destacan un partido frente a Nacional que perdió 3-6 habiendo estado 3-0, o el desempate del Torneo Clausura con Peñarol, ya que luego de igualar en la cima con 37 puntos tuvieron que enfrentarse para clasificar a las finales, partido que River Plate ganaba 3-2 al término del primer tiempo pero que terminó cayendo por 3-5. Ya en las definiciones del campeonato, Defensor Sporting venció a Peñarol. Tras siete años, y provocado por la reestructuración de las competiciones en 2021, el club decidió refundar el equipo debido al brusco cambio entre categorías para los juveniles del club. Diversas noticias informaron en 2022 que el club estaría evaluando la posibilidad de refundar el equipo para la formación de los juveniles, previo paso al equipo filial, militante en la Primera Federación. En la última fase queda eliminado por el Club Deportivo Binisalem, pero por problemas económicos de otros clubes incapaces de asumir los costes de la categoría, la Real Federación Española de Fútbol le vendió una de las plazas vacantes para Segunda División «B».
En el partido de vuelta disputado en la Ciudad Real Madrid de Valdebebas, el conjunto blanco vence por 4-1. En la 2.ª fase elimina a la UD Marbella al ganar 1-2 fuera de casa y 2-0 en la Ciudad del Real Madrid. El uniforme es el mismo que el del primer equipo, el Real Madrid Club de Fútbol, desde su fundación bajo en nombre de Real Madrid Aficionados hasta la actualidad, ya renombrado como Real Madrid Club de Fútbol «C» por la normativa de filiales de 1991 de la Real Federación Española. ↑ Tras el primer filial, el Real Madrid Castilla Club de Fútbol, anteriormente conocido como Real Madrid «B». ↑ «Cuando el Madrid C jugó octavos de Copa ante el Atlético». El mayor éxito del equipo vendría en ese mismo torneo, donde ya bajo el nombre de Copa del Rey alcanzaron los octavos de final en la temporada 1986-87 y fueron eliminados por el Club Atlético de Madrid. Los campeones de cada zona se enfrentan en la Serie del Rey por la Copa Zaachila, camiseta futbol argentina la cual los acredita como el campeón de la liga. Un ejemplo de este sistema son las fases eliminatorias de la Copa Libertadores de América y de la Liga de Campeones de la UEFA.